Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZDHHC9Q9Y397 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZDHHC9Q9Y397 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms