Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX24Q9Y343 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX24Q9Y343 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms