Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG3Q9Y2Y8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG3Q9Y2Y8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG3Q9Y2Y8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms