Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATF5Q9Y2D1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATF5Q9Y2D1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms