Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUDCQ9Y266 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUDCQ9Y266 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms