Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMG5Q9UPR3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMG5Q9UPR3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms