Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PHF8Q9UPP1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PHF8Q9UPP1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PHF8Q9UPP1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms