Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP1B4Q9UN42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP1B4Q9UN42 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP1B4Q9UN42 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms