Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA3Q9UL41 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA3Q9UL41 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms