Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP45Q9UL16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP45Q9UL16 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms