Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC9Q9UKV0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms