Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ADAM28Q9UKQ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ADAM28Q9UKQ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ADAM28Q9UKQ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms