Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC42EP3Q9UKI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms