Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRTO4Q9UKD2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MRTO4Q9UKD2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms