Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RCAN3Q9UKA8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RCAN3Q9UKA8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RCAN3Q9UKA8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms