Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP21Q9UK80 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP21Q9UK80 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP21Q9UK80 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms