Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN4Q9UJW0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN4Q9UJW0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms