Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCSK1NQ9UHG2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK1NQ9UHG2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms