Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AFF4Q9UHB7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFF4Q9UHB7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms