Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUSD2Q9UGT4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUSD2Q9UGT4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUSD2Q9UGT4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms