Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP4Q9UGJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms