Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VTI1BQ9UEU0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VTI1BQ9UEU0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms