Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XCL2Q9UBD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XCL2Q9UBD3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms