Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SUCLA2Q9P2R7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUCLA2Q9P2R7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms