Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CWC15Q9P013 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC15Q9P013 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms