Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSRB1Q9NZV6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSRB1Q9NZV6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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