Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD2Q9NZR1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD2Q9NZR1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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