Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C9orf78Q9NZ63 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C9orf78Q9NZ63 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms