Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKIRAS1Q9NYS0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms