Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMPD3Q9NY59 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMPD3Q9NY59 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms