Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRMT1Q9NXH9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRMT1Q9NXH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms