Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MED29Q9NX70 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MED29Q9NX70 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms