Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PRR4-208ENST00000541175 384 ntTSL 25.64□□□□□ -1.515e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CNNM3-204ENST00000480035 396 ntTSL 55.12□□□□□ -1.595e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.595e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.885e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 DOPEY1-207ENST00000604380 511 ntTSL 50.94□□□□□ -2.265e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.027e-10■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CDKN1B-203ENST00000442489 577 ntTSL 516.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 CDKN1B-204ENST00000477087 453 ntTSL 35.81□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 31.9
RBM22Q9NW64 ERO1A-206ENST00000556039 1855 ntTSL 531.05■■■□□ 2.565e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ERO1A-203ENST00000554019 2094 ntTSL 528.19■■■□□ 2.15e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 PAM-221ENST00000510208 824 ntTSL 225.23■■□□□ 1.635e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.545e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 GFER-202ENST00000561710 482 ntTSL 223.96■■□□□ 1.435e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-201ENST00000261713 826 ntTSL 323.9■■□□□ 1.425e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.375e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-203ENST00000395149 808 ntTSL 223.61■■□□□ 1.375e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.355e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 PAM-225ENST00000512073 575 ntTSL 421.6■■□□□ 1.055e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.945e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 PRKCSH-216ENST00000592445 598 ntTSL 219.3■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 PAM-212ENST00000505654 570 ntTSL 418.66■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.93■□□□□ 0.465e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.335e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ERO1A-204ENST00000554251 555 ntTSL 516.28■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ERO1A-207ENST00000556223 567 ntTSL 416.28■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 GFER-203ENST00000565658 1365 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-207ENST00000582227 424 ntTSL 513.24□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 OSBPL7-208ENST00000583167 4497 ntTSL 212.82□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM98-204ENST00000439138 896 ntTSL 312.67□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-224ENST00000556741 353 ntTSL 211.96□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 CDC27-206ENST00000528748 859 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 OSBPL7-204ENST00000579728 4104 ntTSL 510.87□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 PAM-216ENST00000508060 369 ntTSL 410.45□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-219ENST00000555789 318 ntTSL 39.49□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-215ENST00000554977 569 ntTSL 49.49□□□□□ -0.895e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 PAM-214ENST00000506127 510 ntTSL 39.33□□□□□ -0.925e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 AP1G2-221ENST00000555974 349 ntTSL 38.24□□□□□ -1.095e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.635e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 CDC27-215ENST00000573550 583 ntTSL 34.53□□□□□ -1.685e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 CDC27-212ENST00000570818 656 ntTSL 51.78□□□□□ -2.125e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 CDC27-216ENST00000574304 514 ntTSL 51.48□□□□□ -2.175e-8■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 218.41■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 RHOT2-218ENST00000568636 3098 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 515.14■□□□□ 0.011e-10■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 RASSF4-208ENST00000472561 892 ntTSL 315.07■□□□□ 09e-7■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.145e-19■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-19■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 22.15□□□□□ -2.075e-19■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 40.36□□□□□ -2.355e-19■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 TF-204ENST00000461695 990 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-12■■■■■ 31.8
RBM22Q9NW64 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.816e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.716e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-203ENST00000462725 715 ntTSL 518.1■□□□□ 0.496e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.866e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -16e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-210ENST00000479121 430 ntTSL 53.82□□□□□ -1.86e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.816e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.946e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -26e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-215ENST00000492139 686 ntTSL 52.22□□□□□ -2.056e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.076e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PDCD10-209ENST00000475915 849 ntTSL 52.04□□□□□ -2.086e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 28.47□□□□□ -1.055e-11■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WSB1-209ENST00000581185 1900 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WSB1-205ENST00000487603 1898 ntTSL 210.14□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 33.26□□□□□ -1.893e-9■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.825e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.795e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.715e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SLC25A30-205ENST00000522438 453 ntTSL 525.03■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HLA-A-207ENST00000495183 1766 nt24.82■■□□□ 1.565e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 CBFB-205ENST00000564034 509 ntTSL 223.76■■□□□ 1.395e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.385e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-209ENST00000480417 777 ntTSL 223.54■■□□□ 1.365e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.335e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ST6GALNAC6-207ENST00000463086 505 ntTSL 523.23■■□□□ 1.315e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 ZNF251-204ENST00000530353 2342 ntTSL 222.72■■□□□ 1.235e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 PRMT5-225ENST00000557415 584 ntTSL 222.65■■□□□ 1.225e-6■■■■■ 31.7
RBM22Q9NW64 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 31.7
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