Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ASF1BQ9NVP2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms