Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms