Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC39A9Q9NUM3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC39A9Q9NUM3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms