Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMSN1Q9NSI8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms