Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER2Q9NSB8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms