Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL17Q9NRX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL17Q9NRX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL17Q9NRX2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms