Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAPOLBQ9NRJ5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAPOLBQ9NRJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms