Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
INCENPQ9NQS7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
INCENPQ9NQS7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
INCENPQ9NQS7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms