Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPNPEP3Q9NQH7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPNPEP3Q9NQH7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms