Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A4GALTQ9NPC4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A4GALTQ9NPC4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms