Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPIFA1Q9NP55 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms