Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C10orf88Q9H8K7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C10orf88Q9H8K7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms