Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRDE2Q9H7Z3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRDE2Q9H7Z3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms