Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPA3Q9H6K4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPA3Q9H6K4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPA3Q9H6K4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPA3Q9H6K4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPA3Q9H6K4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms