Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLSTN2Q9H4D0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms