Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD1Q9H3U5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD1Q9H3U5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms