Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCL3Q9H2J4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms